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    简化甲基化测序
    产品简介

            CpG二连核苷常常以成簇串联形式排列,这种富含CpG二连核苷的区域称为CpG岛(CpG islands),其大小为500-1000bp,据研究人类约56%的编码基因上游调控区域含该结构。RRBS(Reduced Representation Bisulfite Sequencing)简化甲基化利用MspI酶富集CG区域酶切片段,从而达到简化甲基化测序目的,来研究甲基化对基因的调控作用,RRBS作为?#24674;?#39640;性价比的甲基化研究方法,在大规模临床样本的研究中具有广泛的应?#20204;?#26223;。



    技术流程


    样品要求

    1)样品类型:无降解且无RNA污染的DNA样品;
     
    2)样品需求量:≥5 μg;单次最低建库起始量可降至200 ng;
     
    3)样品浓度:≥50 ng/μl;
     
    4)适用物种:人和鼠;
     
    5)样品纯度:OD260/280=1.8~2.0。

    案例解析

    案例一:甲基化调控?#21697;?#32946;性[1]

          很多动植物根据温度、光照时长来调节?#32422;?#30340;生物钟,以适应环境的变化;这种调节的是怎样实现,以及对光照长短?#20174;?#30340;分子机理大多还是未知的;?#21697;?#23545;光照有很强的感知能力,秋天的短?#29031;?#20419;使?#21697;?#32477;育,以度过寒冷的冬天;为研究?#21697;?#26159;如何根据光照的长度来调节?#32422;?#32946;性的;本研究中利用RRBS方法探索长短?#29031;棧品?#30002;基化水平的变化,对成年雌性?#21697;?#20998;别做长?#29031;?#21644;短?#29031;?#22788;理,分别进行RRBS甲基化测序,发?#33267;?#20010;基因heix、msn在不同处理组甲基化水平存在明显差异;最后用RNAi的方法沉默甲基化相关的甲基转移酶(Dnmt1a, Dnmt3),?#21697;?#32946;性不受?#29031;?#38271;度的影响;从而揭示了DNA甲基化在调节生物机能中的重要作用。

    参考文献
    [1]Pegoraro M, Bafna A, Davies NJ, Shuker DM, Tauber E. DNA methylation changes induced by long and short photoperiods in Nasonia. Genome Research. 2016;26(2):203-210. doi:10.1101/gr.196204.115.
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